Postdoktorandin / Postdoktorand (d/w/m) Neuroimmunologie an der Charité – Universitätsmedizin Berlin
Aufgaben
- Verantwortung für den Einzelzell-Workflow der Gruppe von der Probenverarbeitung und Sortierstrategie bis zur Datenanalyse und -interpretation
- Entwicklung und Optimierung mehrfarbiger Durchflusszytometrie-Panels für Lymphozytenpopulationen in klinischem Material sowie Durchführung von Zellsortierungen
- Generierung von Einzelzell-Datensätzen aus gepaarten Liquor- und Blutproben, einschließlich Transkriptom- und gepaarter BCR/TCR-Repertoiredaten, sowie Integration dieser Daten zur Charakterisierung krankheitsassoziierter Lymphozytenpopulationen und klonaler Dynamik im Zeitverlauf
- Entwicklung und Bearbeitung einer eigenständigen Forschungsfrage im wissenschaftlichen Fokus der Gruppe, z. B. zur Entstehung von Autoimmunität nach Infektionen des zentralen Nervensystems
- Präsentation der Ergebnisse auf internationalen Konferenzen, Federführung bei der Manuskripterstellung sowie Betreuung von Promovierenden und Medizinstudierenden im Team
Sie werden als wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter beschäftigt: Nach §110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor.
Anforderungen
- Promotion (PhD) in Immunologie, Neurowissenschaften, Systembiologie, Molekularbiologie oder einer verwandten Disziplin; fundierter Hintergrund in Immunologie, insbesondere adaptiven Immunantworten
- Umfangreiche praktische Erfahrung mit primären humanen Immunzellen sowie nachgewiesene Expertise in mehrfarbiger oder Spektral-Durchflusszytometrie, einschließlich Panel-Design, Optimierung, Zellsortierung und Datenanalyse
- Praktische Erfahrung mit Einzelzelltechnologien, einschließlich scRNA-seq und Immunrepertoire-Sequenzierung, von der Probenverarbeitung über die Sortierstrategie bis zur Sequenzierungsvorbereitung
- Eigenständige Analyse von Einzelzelldatensätzen in R oder Python (z. B. Seurat, Scanpy), inklusive Qualitätskontrolle, Integration, Clustering, Zelltyp-Annotation und Differenzialexpression
- Ausgeprägte organisatorische Fähigkeiten und die Fähigkeit, mehrere Projekte parallel zu betreuen, sowie verhandlungssichere Englischkenntnisse in Wort und Schrift; Deutschkenntnisse sind nicht erforderlich.
Von Vorteil
- Erfahrung mit B-Zell-Biologie, Antikörperantworten oder Antikörper-Engineering
- Erfahrung mit limitiertem klinischem Material wie Liquor, Feinnadelaspiraten oder Biopsien
- BCR- oder TCR-Repertoire- und klonale Lineage-Analyse
- Erfahrung mit longitudinalen Probensammlungen und Batch-Design
- CITE-seq, Cell Hashing oder Multiplexing-Ansätze
- Forschungserfahrung im Bereich neuroinflammatorischer, autoimmuner oder postinfektiöser Erkrankungen
Neurologie,
employmentType: Vollzeit
datePosted: 2026-09-11
validThrough: 2026-10-10T00:00:00
Besonderheiten
nicht angegeben
Schlagworte
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